纯化水设备的选择，通常根据客户的需求而定，综合考虑原水水质、水产能、水质标准要求、投资预算等，提供最佳的纯化水制备工艺方案。目前，常用的纯化水制备工艺包括预处理+双级RO、预处理+单级RO+EDI、预处理+双级RO+EDI。预处理工艺包括多介质过滤器、活性炭过滤器、软化器等。
根据2010年版药典标准规定，纯化水电导率≤2μS/cm，而要达到该水质标准一般采用双级反渗透纯化水设备。如果原水水质比较好，比如南方的原水水质电导率在100μS/cm以下，药典标准对制水工艺并没有太大的限制，可采用单级反渗透设备即可满足客户的用水需求。如果客户对水质要求较高，需要达到美国药典标准，建议采用EDI工艺，因为EDI工艺产水比RO产水的电导率更低。通常，北方地区的原水含盐量比较高，可在二级反渗透装置后增加EDI装置，达到深度除盐的目的。
医药行业对纯化水的指标要求较多，纯化水设备究竟采用几级反渗透还需要结合客户的实际来选择合适的工艺，使得投资成本和运行成本合理化，确保系统产水稳定可靠。
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